Die Kernaktivität der Fondazione Sir John Eccles besteht in der Förderung von wissenschaftlichen und philosophischen Studien und Forschungen im Bereich der Neurobiologie, insbesondere im Hinblick auf die Beziehung zwischen Gehirn und Bewusstsein. Die Stiftung organisiert Veranstaltungen, Konferenzen, Symposien und Forschungsprogramme, um den Dialog zwischen Wissenschaftlern, Philosophen und Experten aus verschiedenen Disziplinen zu fördern. Sie unterstützt auch die Veröffentlichung von Forschungsergebnissen und die Organisation von Kulturveranstaltungen, um die Öffentlichkeit über die neuesten Entwicklungen in diesem Bereich zu informieren.