Die Kernaktivität der Guido Fluri Stiftung besteht in der Unterstützung und Förderung von Projekten und Initiativen, die sich für die Rechte und das Wohlergehen von Kindern, Menschen mit Schizophrenie und anderen vulnerable Gruppen einsetzen. Insbesondere konzentriert sich die Stiftung auf die Aufarbeitung von Kindsmissbrauchsfällen, die Unterstützung von Menschen mit Hirntumoren und die Förderung von Initiativen, die sich für die Rechte von Menschen mit psychischen Erkrankungen einsetzen. Die Stiftung engagiert sich auch in der Organisation von Veranstaltungen und Projekten, die darauf abzielen, die Öffentlichkeit für diese Themen zu sensibilisieren und Unterstützung zu mobilisieren.