L'activité principale de la Fondation Agapetos consiste à soutenir et financer des projets et des actions humanitaires, en particulier au profit des communautés chrétiennes et des chrétiens persécutés, principalement au Moyen-Orient. La Fondation se concentre sur les domaines de l'éducation, de l'alimentation, de la santé, du logement et du soutien social. Elle agit à la fois au niveau local et international et poursuit l'objectif d'aider les populations vulnérables et de leur donner la possibilité de se renforcer et de se développer de manière durable.